中医健康管理师证书考试的机构有很多，其中国家中医药管理局中医师资格认证中心是其中一个，还有一些其他的机构也提供中医健康管理师证书考试的服务，中国中医药科技出版社、北京中医药大学、上海市中医药高等专科学校等。