健康管理师证书分为两种：国家职业资格证书和职业技能等级证书，在2017年之前，健康管理师证书由人社部统一组织，各省、自治区职业鉴定中心考核发证，2017年9月12日，经国务院同意，人力资源社会保障部公布140项国家职业资格目录，并强调国家按照规定的条件和程序将职业资格纳入国家职业资格目录，实行统一管理。

目前，健康管理师证书分为五种：健康管理师(一级/高级技师)、健康管理师(二级/技师)、健康管理师(三级/高级)、健康管理师(四级/中级)、健康管理师(五级/初级) 。