康复理疗师证发证机关是指负责颁发康复理疗师证书的政府部门或机构，在中国，康复理疗师证书由国家卫生健康委员会(原卫生部)颁发，康复理疗师证发证机关就是国家卫生健康委员会。

填写康复理疗师证发证机关的方法如下：

1、首先要确保你已经通过了康复理疗师的考试，获得了相应的资格证书。

2、在填写相关表格时，找到“证书颁发单位”或“证书编号”等类似的栏目。

3、在这些栏目中填写“国家卫生健康委员会”或“原卫生部”。

4、根据需要，你还可以提供国家卫生健康委员会的官方网站地址或其他相关信息，以便他人核实你的证书真实性。

5、仔细检查填写的信息，确保无误后提交。

需要注意的是，康复理疗师证书是从事康复理疗工作的必备证件，具有很高的权威性，在填写相关信息时，务必确保准确无误，以免给今后的工作带来不必要的麻烦，随着康复理疗行业的发展，不同地区和机构可能会有不同的颁发标准和流程，因此在实际操作中，还需参考当地的相关规定。