心灵疗愈师证书的等级分为初级、中级、高级三个等级，每个等级又分为三个阶段，共计九个阶段。

初级阶段包括：心灵疗愈基础课程、心灵疗愈实践技能培训、心灵疗愈实践操作考核；

中级阶段包括：心灵疗愈进阶课程、心灵疗愈专业技能培训、心灵疗愈专业技能考核；

高级阶段包括：心灵疗愈高级课程、心灵疗愈高级专业技能培训、心灵疗愈高级专业技能考核。