心理健康咨询师证书报考机构有很多，以下是一些比较知名的机构：

1、中国心理卫生协会心理咨询师培训中心

2、北京师范大学心理学系

3、华东师范大学心理与认知科学学院

4、华中师范大学心理学院

5、中国人民大学心理学系

6、上海交通大学社会与公共事务学院

7、广州中山大学社会工作与管理学院

8、武汉大学社会科学院心理研究所

9、西南大学心理学院

10、东北师范大学心理学院